通过对比120,000多名欧洲血统女性基因结构的微小变化，英国癌症研究所的一项乳腺癌全基因组关联研究(GWAS)发现：15个新的基因位点会增加女性患乳腺癌的风险。这项新研究的发布，意味着通过研究已经有总计超过90个与乳腺癌相关的SNPs被发现。该项研究由来自世界各地的数十位乳腺癌协会联合会科学家合作完成，并被发布在3月9日《自然遗传学》(《Nature Genetics》)上。
乳腺癌是英国最常见的癌症类型，每年几乎有50,000名妇女被确诊，大约每8名女性就会有1名女性患上乳腺癌。经过研究显示，大约5%的女性是由于携带足够多的遗传变异基因而患上本病，这部分女性患乳腺癌的风险会增加约1/4。而大约0.7%的女性患乳腺癌的风险约增加1/3。癌症筛查和预防措施对于降低乳腺癌患者人数有着重要意义。
本项研究的研究对象为120,000多名欧洲血统女性。GWAS研究和大量的重复研究已经鉴定了79个和乳腺癌相关的位点，这在一定程度上解释了乳腺癌的家族风险。为了鉴定新的易感基因位点，研究人员对11个GWAS研究和41个独立研究进行了Meta分析。这11个GWAS研究共包含了15748个乳腺癌病例和18084个对照;而这41个独立的研究包括了46785个病例和42892个对照。通过研究其基因结构的微小变化，研究人员确定了15个新的基因位点，这些新的变异与更高的疾病风险有关，研究人员将其被称作单核苷酸多态性(SNPs)。
剑桥大学遗传流行病学教授Doug Easton为本次研究的通讯作者，他强调说，本次研究对于解开乳腺癌之谜有着重大突破，这15个新的位点能够帮助我们更深入的了解乳腺癌高风险患者的遗传原因以及如何遗传，对于高危女性的癌症筛查和预防措施的改进有着重要的意义。解决乳腺癌难题的下一步是了解更多关于“遗传变异如何导致妇女患病风险提高”的信息。当然，有更多的变化仍然有待去发掘。
这项新研究将会为乳腺癌遗传图谱增加更多的细节，并促进乳腺癌高风险女性的新筛查方法的开发，以帮助在最早期识别乳腺癌病患——英国癌症研究中心高级科学传播经理Nell Barrie。
原始出处：http://www.nature.com/ng/journal/vaop/ncurrent/full/ng.3242.html
Genome-wide association analysis of more than 120,000 individuals identifies 15 new susceptibility loci for breast cancer
Genome-wide association studies (GWAS) and large-scale replication studies have identified common variants in 79 loci associated with breast cancer, explaining ~14% of the familial risk of the disease. To identify new susceptibility loci, we performed a meta-analysis of 11 GWAS, comprising 15,748 breast cancer cases and 18,084 controls together with 46,785 cases and 42,892 controls from 41 studies genotyped on a 211,155-marker custom array (iCOGS). Analyses were restricted to women of European ancestry. We generated genotypes for more than 11 million SNPs by imputation using the 1000 Genomes Project reference panel, and we identified 15 new loci associated with breast cancer at P < 5 × 10−8. Combining association analysis with ChIP-seq chromatin binding data in mammary cell lines and ChIA-PET chromatin interaction data from ENCODE, we identified likely target genes in two regions: SETBP1 at 18q12.3 and RNF115 andPDZK1 at 1q21.1. One association appears to be driven by an amino acid substitution encoded inEXO1.